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創(chuàng)建跨物種數(shù)據(jù)庫和通用“時鐘”,從DNA變化可推測哺乳動物壽命

2023-08-12 15:34:20    來源:科技日報


(相關(guān)資料圖)

科學(xué)家在哺乳動物衰老和壽命研究領(lǐng)域取得了重磅成果。美國加州大學(xué)洛杉磯分校大衛(wèi)格芬醫(yī)學(xué)院和加州大學(xué)洛杉磯分校健康中心科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的國際研究小組,以兩篇開創(chuàng)性研究詳細介紹了一種DNA變化,而人類和其它哺乳動物在整個歷史上都有這種變化,其與所有物種的壽命和許多其他特征息息相關(guān)。

該圓形圖顯示了通過開發(fā)的兩種通用時鐘所估計的不同物種年齡和DNA甲基化之間的相關(guān)性。

圖源:阿克·盧和史蒂夫·霍瓦特/Eurekalert

兩項研究分別發(fā)表在《科學(xué)》和《自然·衰老》雜志上。科學(xué)家建立了“哺乳動物通用時鐘”,這其實是一個可以準(zhǔn)確估計所有哺乳動物年齡的數(shù)學(xué)公式,通過這一“時鐘”,科學(xué)家重點關(guān)注了DNA甲基化或胞嘧啶(DNA分子的四個組成部分之一)甲基化。

為了研究DNA甲基化的影響,近200名研究人員組成的“哺乳動物甲基化聯(lián)盟”,收集并分析了來自348種哺乳動物的15000多個動物組織樣本的甲基化數(shù)據(jù),最終發(fā)現(xiàn)甲基化譜的變化與進化過程中遺傳的變化密切相關(guān),表明基因組和表觀基因組的進化相互交織,影響著不同物種的生物學(xué)特性和特征。

兩篇文章的資深作者、加州大學(xué)洛杉磯分校人類遺傳學(xué)和生物統(tǒng)計學(xué)教授史蒂夫·霍瓦特解釋說,他們發(fā)現(xiàn)哺乳動物的壽命與DNA分子的化學(xué)修飾密切相關(guān),特別是表觀遺傳學(xué),或更準(zhǔn)確地說是甲基化。從本質(zhì)上講,壽命較長的哺乳動物表現(xiàn)出更明顯的DNA甲基化模式,而壽命較短的物種則具有更柔和、更平坦的甲基化模式。

該校生物化學(xué)、計算機科學(xué)和計算醫(yī)學(xué)教授杰森·恩斯特表示,此次設(shè)計的用于測量哺乳動物DNA甲基化水平的最新技術(shù)以及大量組織樣本貢獻,帶來了高度獨特的數(shù)據(jù)集,當(dāng)使用先進的計算和統(tǒng)計工具進行分析時,就揭示了哺乳動物DNA甲基化、壽命、衰老和其他生物過程之間更深入的關(guān)系。

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